LearningR-XML
因为要读取一个XML格式的数据,学习整理XML包。
1.XML包
1.1. 载入XML文件
有两种方法:
通过函数xmlTreeParse("file.xml")载入xml文件,如果不加入参数,将获得关于这个xml文件的所有信息。所以,这个函数通常配合xmlRoot()使用,比如xmlRoot(xmlTreeParse("file.xml"))以得到xml主体文件。
通过函数xmlTreeParse("file.xml", useInternalNodes = TRUE)来得到加入首行的xml文件主体
library(RCurl)library(XML)urlXPath 语法使用函数getNodeSet(doc, XPath)XPath的常见用法:1. 获取第一个son元素/root/son[1]
getNodeSet(d, "/bookstore/book[1]")
1. 获取最后一个son元素/root/son[last()]
getNodeSet(d, "/bookstore/book[last()]")
1. 获取前两个son元素/root/son[position()
getNodeSet(d, "/bookstore/book[position() 1. 获取任意son2元素
//son2
getNodeSet(d, "/bookstore/book")getNodeSet(d, "/bookstore/book/title")
- 获取任意son2的age属性
//son2[@age]
getNodeSet(d, "//book[@category]")
- 获取任意son2的age属性等于18的元素
//son2[@age=18]
getNodeSet(d, "//book[@category='web']")
- 获取root下所有元素
/root/*
getNodeSet(d, "/bookstore/*")
- 获取所有带属性的son元素
//son[@*]
getNodeSet(d, "//book[@*]")
节点相关函数
class(xmltop) # 查看类
xmlName(node):查看根目录名。
node[[1]]:查看第一个子目录
node[1]]:查看第一个子目录的第二个节点
xmlSize(node):该节点下字节点数量。
xmlAttrs(node):该节点属性。
xmlGetAttr(node, attr):该节点某一属性。
xmlValue(node):该节点值。
xmlChildren(node):该节点下的子节点。
class(d)xmlName(d)xmlSize(d)xmlAttrs(d)xmlAttrs(d[[1]])xmlAttrs(d[[1]][[1]])xmlGetAttr(d[[1]][[1]], "lang")xmlChildren(d[[1]])# 通过以下方式获得的节点类型不同,建议使用getNodeSetd[[1]][[1]]getNodeSet(d, "//book/title")[[1]]getNodeSet(d, "//book[1]/title")
1.3 xmlSApply和xmlApply
- 读取节点的值
# 读取第一本书的"title"的值d[[1]][[1]][[1]]xmlValue(d[[1]][[1]])xpathSApply(d, "/bookstore/book[1]/title", xmlValue)xpathSApply(d, "//book[1]/title", xmlValue)xpathSApply(d, "//book/title", xmlValue)xpathSApply(d, "//book[1]/title", xmlName)xpathSApply(d, "//book[1]/title", xmlSize)xpathSApply(d, "//book[1]/title", xmlAttrs)# xpathSApply和xpathApply的区别:# xpathSApply是xpathApply读取值的一个因子xpathApply(d, "//book[1]/title", xmlName)xpathApply(d, "//book[1]/title", xmlSize)xpathApply(d, "//book[1]/title", xmlAttrs)
- 读取节点的属性值
xmlGetAttr(d[[1]][[1]], "lang")title<-getNodeSet(d, "//book[1]/title")title_lang<-sapply(title, xmlGetAttr, "lang")sapply(xmlChildren(d), xmlGetAttr, "category")# 也可以通过该方法读取节点的值title_value<-sapply(title, xmlValue)sapply(xmlChildren(d[["book"]]), xmlValue)
1.4 xml格式转dataframe
book <- getNodeSet(d, "//book")mybook <- sapply(book,xmlValue)# 第一种方式,直接用xmlToDataFrame()函数xmlToDataFrame(d)# 由于book[4]不规范,导致转化失败xmlToDataFrame(xmlChildren(d)[["book"]])xmlToDataFrame(getNodeSet(d, "//book[1]"))xmlToDataFrame(nodes = getNodeSet(d, "//book/title"))# 第二种方式,数据格式处理专用包plyrlibrary("plyr")# 先转成list,再转dataframeMyBooks <- ldply(xmlToList(d), data.frame)MyBooks <- ldply(xmlToList(getNodeSet(d, "//book")), data.frame)# 第三种方式,读取单个值后组合为dataframeauthor <- xpathSApply(d, "//book/author", xmlValue)# 对第四个book的author值做特殊处理author4 <- xpathSApply(d, "//book[4]/author", xmlValue)author4 <- paste(author4, collapse = ", ")author <- c(author[1:3],author4)MyBooks <- data.frame( category=sapply(xmlChildren(d), xmlGetAttr, "category"), title=xpathSApply(d, "//book/title", xmlValue), author, year=xpathSApply(d, "//book/year", xmlValue), price=xpathSApply(d, "//book/price", xmlValue))
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